250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2417 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
324 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  72.76 
 
 
324 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  65.35 
 
 
352 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  33.89 
 
 
360 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
353 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  33.05 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 
365 aa  158  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.38 
 
 
365 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.65 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  29.53 
 
 
370 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.46 
 
 
345 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.61 
 
 
347 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.38 
 
 
344 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.59 
 
 
345 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.76 
 
 
344 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.06 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.06 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.72 
 
 
341 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.96 
 
 
343 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.83 
 
 
348 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 
344 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 
344 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.04 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.41 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.23 
 
 
343 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.84 
 
 
343 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.07 
 
 
351 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.35 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.33 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.1 
 
 
343 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 
337 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 
337 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.51 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  34.6 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  31.21 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.41 
 
 
338 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
342 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.46 
 
 
351 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 
343 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 
338 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
340 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.68 
 
 
337 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.81 
 
 
338 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 
340 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
346 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.87 
 
 
357 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.11 
 
 
338 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  32.54 
 
 
337 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  31.49 
 
 
336 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.93 
 
 
351 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.11 
 
 
345 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  31.76 
 
 
340 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.63 
 
 
344 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  32.25 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  31.3 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 
339 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.91 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  28.48 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
349 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 
352 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.12 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.36 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.24 
 
 
342 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.11 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  27.99 
 
 
357 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.57 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 
342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.88 
 
 
350 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  27.89 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  29.29 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.24 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  29.05 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  29.27 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.41 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.07 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.03 
 
 
343 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>