More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2126 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2126  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 470 aa  894    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4355  AMP-dependent synthetase and ligase  59.03 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6585  AMP-dependent synthetase and ligase  47.12 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4032  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 		 501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  29.77 
 
 		 529 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  30.69 
 
 		 523 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  35.01 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 546 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  29.03 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2717  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 544 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 		 502 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 504 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 516 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  27.87 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  29.6 
 
 		 508 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  28.38 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2665  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 521 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535194  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 510 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  28.21 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.07 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 541 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  31.45 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 		 526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 516 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 		 532 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.5 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  30.02 
 
 		 552 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.48 
 
 		 525 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 514 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 518 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  28.52 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  32.25 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.45 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 564 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0987  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 499 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  28.4 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.22 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.31 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.96 
 
 		 519 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.33 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2482  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>