More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4355 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4355  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 475 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2126  AMP-dependent synthetase and ligase  59.54 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6585  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 		 479 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4032  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 715 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  31.88 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  31.79 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  29.62 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2665  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 521 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535194  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  29.18 
 
 		 514 aa  163  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.07 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  30.32 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  29.71 
 
 		 529 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  30.15 
 
 		 520 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 517 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.93 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2717  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 544 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  30.29 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 496 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.13 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.13 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2482  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.87 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.72 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.72 
 
 		 510 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.74 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  32.1 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  27.32 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 		 560 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 498 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.83 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.98 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 518 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.54 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.32 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 567 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  29.18 
 
 		 492 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.54 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 562 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  28.82 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 505 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.75 
 
 		 481 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 517 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 512 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  27.01 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 541 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  27.47 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 501 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.33 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  26.8 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  28.69 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>