More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2717 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2717  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 544 aa  1087    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  31.76 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 715 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  31.11 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  31.11 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 532 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 516 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  32.96 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 544 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  31.34 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  33.53 
 
 		 571 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  29.41 
 
 		 531 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  30.4 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 525 aa  163  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  30.06 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  28.23 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  35.38 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  29.57 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 517 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  27.29 
 
 		 552 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.19 
 
 		 662 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  27.1 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.75 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.05 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  27.64 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  33.05 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.15 
 
 		 549 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 		 575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 521 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 515 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  27.72 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.47 
 
 		 575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 571 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 596 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4738  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 539 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256457  normal  0.674597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  28.97 
 
 		 540 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  29.27 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 518 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 516 aa  153  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.16 
 
 		 539 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  26.34 
 
 		 549 aa  153  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  28.33 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  31.41 
 
 		 560 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.43 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 515 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.81 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  30.33 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.57 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  32.49 
 
 		 552 aa  151  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 564 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28.14 
 
 		 556 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>