More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0959 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1023    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.4 
 
 		 527 aa  280  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 530 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 525 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.76 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 526 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 511 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 		 519 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 520 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 520 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 525 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 520 aa  259  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 523 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.4 
 
 		 486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 518 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 512 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 522 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 522 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 499 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 504 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 504 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 519 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 518 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 496 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 518 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  30.77 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 518 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 500 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.27 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 487 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 515 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  33.47 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  29.64 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 534 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 517 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.76 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 1043 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  29.33 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 491 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 491 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  28.91 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  28.91 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 491 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.71 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 		 523 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.71 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.84 
 
 		 556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.77 
 
 		 497 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 518 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.18 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  30.71 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 517 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 515 aa  210  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>