More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2482 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2665  AMP-dependent synthetase and ligase  85.58 
 
 		 521 aa  894    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535194  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2482  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 559 aa  1115    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 715 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 531 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 		 520 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  32.49 
 
 		 502 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 520 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 528 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  32.3 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 517 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 521 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 516 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 559 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  30.72 
 
 		 523 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  31.52 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  31.98 
 
 		 514 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  36.09 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  36.09 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 506 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 505 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 521 aa  173  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  35.76 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  35.69 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 		 530 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.66 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 		 528 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  35.71 
 
 		 571 aa  167  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.16 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 524 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  28.01 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 521 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 519 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 		 524 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 520 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.44 
 
 		 491 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 526 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  27.15 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  28.6 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 559 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 521 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  29.41 
 
 		 532 aa  151  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 519 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1890  putative acid-CoA ligase  31.38 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 526 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 549 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>