More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1890 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1890  putative acid-CoA ligase  100 
 
 		 515 aa  1032    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.98 
 
 		 491 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 5154 aa  263  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  35.12 
 
 		 4930 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  34.37 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  34.51 
 
 		 504 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.71 
 
 		 6768 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  35.4 
 
 		 4575 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 522 aa  227  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  34.43 
 
 		 2376 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 520 aa  226  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  32.58 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  32.58 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  35.04 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.56 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  32.08 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  32.66 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  34.63 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  33.68 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  33.47 
 
 		 2374 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  33.26 
 
 		 509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.64 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.44 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  36.41 
 
 		 632 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 508 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  32.43 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  36.41 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  32.56 
 
 		 505 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  28.84 
 
 		 496 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 509 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  30.85 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  32.49 
 
 		 512 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  31.94 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.02 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.02 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  37.25 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  32.54 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  33.05 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  33.4 
 
 		 508 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  31.66 
 
 		 511 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 506 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  31.77 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 		 633 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  32.99 
 
 		 547 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  31.77 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 499 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 490 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  31.55 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  30.63 
 
 		 504 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  32.1 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  31.69 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  30.96 
 
 		 507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 508 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  29.63 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 521 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  31.16 
 
 		 507 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 492 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 507 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  31.92 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 583 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 512 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.21 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  34.7 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  34.7 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  32.86 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 546 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  34.59 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 526 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 553 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.16 
 
 		 516 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.44 
 
 		 515 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>