More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4840 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
522 aa  1081    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6285  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.586819  normal  0.531753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 
498 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6098  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.36 
 
 
503 aa  279  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
553 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.01 
 
 
544 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.01 
 
 
513 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
527 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 
514 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.58 
 
 
518 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.27 
 
 
529 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  31.45 
 
 
496 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.51 
 
 
549 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.38 
 
 
549 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
526 aa  249  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  32.5 
 
 
576 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  32.5 
 
 
576 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  32.5 
 
 
576 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  32.5 
 
 
570 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 
518 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
492 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 
576 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 
576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  31.24 
 
 
496 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 
510 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  32.11 
 
 
576 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.98 
 
 
576 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 
496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 
496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 
510 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  32.43 
 
 
576 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.74 
 
 
552 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 
576 aa  243  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
545 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 
510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  31.62 
 
 
552 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
510 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 
490 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
546 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.14 
 
 
512 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 
510 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 
561 aa  240  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.86 
 
 
510 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
508 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  31.37 
 
 
560 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
561 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
521 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
563 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
512 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
561 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.67 
 
 
514 aa  239  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
499 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
563 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
662 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 
582 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  32.46 
 
 
533 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
563 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
563 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
518 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
501 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
582 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 
511 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 
547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  31.26 
 
 
568 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 
552 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
504 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.08 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.3 
 
 
514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 
576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  32.31 
 
 
533 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.54 
 
 
575 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 
576 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
554 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 
1043 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
566 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
513 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 
502 aa  233  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  31.05 
 
 
549 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  31.46 
 
 
575 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.55 
 
 
509 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.15 
 
 
561 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 
549 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 
487 aa  232  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  30.91 
 
 
575 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  31.53 
 
 
550 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
569 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>