More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10120 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
542 aa  1079    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
504 aa  293  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
506 aa  289  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  37.69 
 
 
506 aa  287  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 
526 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 
506 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
526 aa  282  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
532 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
506 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  34.62 
 
 
535 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
508 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  42.06 
 
 
510 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 
511 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  37.2 
 
 
511 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
503 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
511 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
513 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
509 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
553 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  39.89 
 
 
2167 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
553 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
520 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.19 
 
 
491 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
507 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
525 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 
487 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
539 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 
514 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.92 
 
 
485 aa  220  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 
4930 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 
524 aa  213  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  26.94 
 
 
584 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
506 aa  207  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
558 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.31 
 
 
587 aa  206  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
5154 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.81 
 
 
552 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 
502 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
512 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
521 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  32.76 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.23 
 
 
622 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  26.93 
 
 
596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 
602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  34.4 
 
 
4575 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.52 
 
 
579 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.07 
 
 
560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.3 
 
 
510 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  28.76 
 
 
571 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
490 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29 
 
 
576 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.49 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
523 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.15 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.9 
 
 
500 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.41 
 
 
576 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 
575 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 
512 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
507 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
523 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  28.55 
 
 
576 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 
561 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.98 
 
 
510 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
561 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 
492 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
551 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 
564 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
509 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 
518 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  27.66 
 
 
575 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 
553 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  27.66 
 
 
575 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
619 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  27.85 
 
 
575 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 
570 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  29.38 
 
 
575 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  29.38 
 
 
575 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 
575 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
1453 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>