More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1366 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
485 aa  993    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
532 aa  312  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
507 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1263  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.29 
 
 
519 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 
504 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
494 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
506 aa  259  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 
506 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
508 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  32.32 
 
 
506 aa  246  6e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 
546 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.58 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
509 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
509 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 
553 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
524 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
506 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 
514 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  36.06 
 
 
535 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
553 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.35 
 
 
512 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
512 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 
503 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
526 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 
542 aa  220  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
520 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
526 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
526 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
511 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  29.86 
 
 
511 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
510 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 
496 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 
496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 
496 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 
496 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.55 
 
 
491 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 
553 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.4 
 
 
510 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 
513 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
502 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6285  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
506 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.586819  normal  0.531753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.77 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 
662 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.77 
 
 
510 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.56 
 
 
510 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.23 
 
 
518 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.56 
 
 
510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  34.83 
 
 
2167 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.36 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28 
 
 
509 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
513 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
583 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.02 
 
 
518 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 
521 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
502 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 
506 aa  193  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.87 
 
 
593 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
490 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 
504 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 
518 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.87 
 
 
619 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  27.87 
 
 
619 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
1453 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.33 
 
 
622 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 
507 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  27.66 
 
 
619 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 
518 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 
514 aa  189  9e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 
518 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 
545 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
560 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  27.46 
 
 
593 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 
512 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  27.46 
 
 
619 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
506 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 
505 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.02 
 
 
518 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.99 
 
 
513 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.45 
 
 
529 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 
585 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.29 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  28.42 
 
 
526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  28.07 
 
 
517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 
499 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.07 
 
 
516 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 
551 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>