More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0430 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.49 
 
 		 593 aa  1194    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  99.66 
 
 		 593 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  90.03 
 
 		 622 aa  1118    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  99.35 
 
 		 619 aa  1242    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 		 619 aa  1252    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  99.52 
 
 		 619 aa  1246    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.52 
 
 		 619 aa  1246    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 520 aa  323  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 		 506 aa  298  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  36.15 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 490 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 		 514 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 662 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 		 512 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 499 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.38 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 495 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 503 aa  249  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.16 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.82 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 494 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 510 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.39 
 
 		 515 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  243  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  243  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 510 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 485 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 498 aa  240  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 514 aa  240  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.24 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 569 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 487 aa  237  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.93 
 
 		 529 aa  237  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 505 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 521 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  37.13 
 
 		 506 aa  236  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.63 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 536 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.37 
 
 		 514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.13 
 
 		 503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 500 aa  234  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 563 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 563 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 563 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 563 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 504 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 527 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 571 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 575 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.42 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 523 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 		 561 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 519 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 582 aa  230  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 524 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 549 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.46 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 511 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.64 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  30.63 
 
 		 571 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  36.76 
 
 		 501 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>