More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2527 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
504 aa  1027    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  68.54 
 
 
506 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  66.67 
 
 
506 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  53.97 
 
 
526 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  54 
 
 
512 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 
526 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 
526 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  50.89 
 
 
535 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  53.39 
 
 
510 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  55.49 
 
 
506 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  52.28 
 
 
513 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  54.33 
 
 
511 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  54.13 
 
 
511 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2528  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
342 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314278  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  55.83 
 
 
511 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  45.77 
 
 
506 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 
532 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  41.12 
 
 
2167 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 
525 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
520 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 
508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
1453 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  38.3 
 
 
542 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
509 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
524 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
509 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
507 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 
502 aa  279  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 
510 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 
510 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  35.22 
 
 
553 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 
510 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
487 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 
510 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 
485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
504 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
553 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 
510 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 
510 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
546 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
500 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
521 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.1 
 
 
491 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  34.97 
 
 
1503 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 
492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 
499 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
514 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 
585 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  34.35 
 
 
1643 aa  253  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 
510 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 
539 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.83 
 
 
512 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
510 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
514 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
495 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 
662 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.6 
 
 
516 aa  243  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
5154 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.49 
 
 
513 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
516 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
571 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.96 
 
 
500 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  34.13 
 
 
526 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
506 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 
593 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  32.74 
 
 
619 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 
564 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 
619 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 
561 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
498 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 
561 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  32.74 
 
 
593 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  32.8 
 
 
619 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
619 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 
582 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.23 
 
 
561 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
587 aa  233  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
552 aa  233  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 
514 aa  233  9e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
566 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
522 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 
561 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
518 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 
504 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 
553 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
583 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
511 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
527 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>