More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_48436 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  100 
 
 
1503 aa  3100    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  34.69 
 
 
1643 aa  796    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43214  predicted protein  32.77 
 
 
1657 aa  753    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
512 aa  291  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
1453 aa  284  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 
513 aa  268  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
506 aa  266  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
504 aa  265  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
526 aa  262  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
526 aa  262  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
526 aa  261  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  34.48 
 
 
535 aa  258  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 
510 aa  249  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
506 aa  246  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 
506 aa  237  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  35.16 
 
 
511 aa  230  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
511 aa  230  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
511 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  32.08 
 
 
506 aa  212  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
500 aa  196  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  28.87 
 
 
2167 aa  195  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37273  predicted protein  29.47 
 
 
674 aa  193  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 
532 aa  193  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
507 aa  187  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 
514 aa  188  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 
521 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  30.48 
 
 
542 aa  187  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
509 aa  186  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
525 aa  185  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 
524 aa  182  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 
512 aa  182  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
502 aa  182  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
503 aa  181  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
546 aa  181  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
520 aa  178  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 
499 aa  178  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 
553 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
487 aa  177  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 
512 aa  175  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 
510 aa  174  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
553 aa  174  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
507 aa  172  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 
506 aa  172  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.62 
 
 
510 aa  171  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 
492 aa  171  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 
504 aa  171  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 
510 aa  170  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.4 
 
 
510 aa  170  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.96 
 
 
510 aa  170  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.51 
 
 
510 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
509 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  28.96 
 
 
506 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  26.99 
 
 
515 aa  169  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 
510 aa  169  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 
494 aa  169  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.15 
 
 
491 aa  168  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
508 aa  168  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 
506 aa  167  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.72 
 
 
510 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.72 
 
 
510 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 
510 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.72 
 
 
510 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 
508 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.16 
 
 
513 aa  167  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27 
 
 
485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.6 
 
 
503 aa  166  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.71 
 
 
510 aa  166  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
530 aa  166  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1263  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.58 
 
 
519 aa  165  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.78 
 
 
509 aa  165  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  27.75 
 
 
506 aa  164  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  27.52 
 
 
536 aa  163  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  28.63 
 
 
511 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
569 aa  163  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.35 
 
 
561 aa  164  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  27.95 
 
 
519 aa  162  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 
511 aa  163  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
501 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  27.89 
 
 
504 aa  162  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 
536 aa  162  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  27.31 
 
 
504 aa  162  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  28.93 
 
 
507 aa  161  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
519 aa  161  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 
4930 aa  161  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
577 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  26.17 
 
 
496 aa  160  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.03 
 
 
555 aa  160  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
525 aa  160  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 
566 aa  160  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 
516 aa  160  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
512 aa  160  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  27.74 
 
 
519 aa  160  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 
561 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.3 
 
 
500 aa  159  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  29.38 
 
 
530 aa  159  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 
557 aa  159  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
507 aa  158  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  27.19 
 
 
526 aa  158  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.53 
 
 
563 aa  158  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
515 aa  158  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>