More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43214 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43214  predicted protein  100 
 
 		 1657 aa  3409    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  55.63 
 
 		 1643 aa  1770    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  32.77 
 
 		 1503 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 1453 aa  294  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 526 aa  268  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 526 aa  267  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 526 aa  267  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 512 aa  261  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  42.15 
 
 		 506 aa  250  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 510 aa  246  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 511 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  34.22 
 
 		 511 aa  224  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  36.19 
 
 		 535 aa  219  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 504 aa  217  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 511 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 506 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 513 aa  208  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 506 aa  201  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  33.59 
 
 		 2167 aa  199  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 532 aa  192  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 508 aa  190  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37273  predicted protein  29.43 
 
 		 674 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757567  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  34.97 
 
 		 506 aa  182  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  34.66 
 
 		 542 aa  177  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 507 aa  173  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  32.69 
 
 		 553 aa  173  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 553 aa  172  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 494 aa  171  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 514 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 509 aa  169  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 546 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 509 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.91 
 
 		 485 aa  167  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1699  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 1433 aa  164  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 502 aa  164  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 499 aa  160  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 		 512 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1263  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.94 
 
 		 519 aa  157  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  27.98 
 
 		 515 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 510 aa  154  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 		 521 aa  154  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 507 aa  153  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 508 aa  152  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 513 aa  150  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 		 518 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 512 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 504 aa  149  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 500 aa  149  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  31.19 
 
 		 504 aa  149  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 506 aa  149  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 		 579 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  30.99 
 
 		 504 aa  147  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 506 aa  146  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  30.18 
 
 		 506 aa  146  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.29 
 
 		 509 aa  146  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  30.62 
 
 		 504 aa  145  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  34.17 
 
 		 530 aa  145  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 527 aa  145  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 522 aa  145  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 487 aa  144  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  29.02 
 
 		 572 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 511 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.1 
 
 		 510 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  29.73 
 
 		 504 aa  143  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  27.04 
 
 		 578 aa  143  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 502 aa  143  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 524 aa  143  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  30.52 
 
 		 547 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 507 aa  142  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 570 aa  142  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 		 662 aa  142  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 520 aa  142  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 576 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 502 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 576 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 576 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 521 aa  141  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 576 aa  141  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 576 aa  141  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  25.82 
 
 		 633 aa  141  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  31.55 
 
 		 503 aa  141  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  29.89 
 
 		 519 aa  141  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 545 aa  141  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  28.44 
 
 		 576 aa  141  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.81 
 
 		 576 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.12 
 
 		 534 aa  140  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.01 
 
 		 503 aa  140  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.85 
 
 		 516 aa  140  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 501 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5258  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 505 aa  140  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 502 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.25 
 
 		 549 aa  140  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  31.42 
 
 		 503 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 502 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 569 aa  140  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  32.04 
 
 		 503 aa  140  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 502 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.13 
 
 		 510 aa  140  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.82 
 
 		 561 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.47 
 
 		 561 aa  140  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>