More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1150 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
509 aa  1039    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.58 
 
 
485 aa  244  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
532 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1263  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.81 
 
 
519 aa  238  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
487 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
546 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
509 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 
504 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 
514 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
509 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
520 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
508 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.56 
 
 
491 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
485 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.27 
 
 
512 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
553 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 
553 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 
510 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
512 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 
510 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
506 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
525 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  30.62 
 
 
506 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 
510 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
662 aa  200  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  33.43 
 
 
2167 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
513 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 
506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
526 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
526 aa  192  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
526 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  28.4 
 
 
503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  33.33 
 
 
535 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  32.14 
 
 
510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
511 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.65 
 
 
516 aa  183  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  34.17 
 
 
511 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.77 
 
 
513 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 
563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 
563 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 
563 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 
582 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.24 
 
 
495 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 
563 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 
561 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.77 
 
 
561 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.77 
 
 
561 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
512 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
577 aa  176  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
521 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 
542 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.7 
 
 
561 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 
536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.65 
 
 
524 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
498 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 
579 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
505 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.43 
 
 
514 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
564 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
507 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 
521 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.11 
 
 
504 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
533 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 
496 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 
496 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.59 
 
 
496 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 
508 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 
496 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
519 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
577 aa  167  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.02 
 
 
498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 
508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  29.01 
 
 
619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.13 
 
 
518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 
506 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  28.73 
 
 
619 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>