More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4343 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  68.54 
 
 		 504 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 506 aa  1015    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  88.74 
 
 		 506 aa  855    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  53.66 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  53.47 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  53.09 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  52.54 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  54.47 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  49.42 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  54.03 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  54.03 
 
 		 511 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  54.91 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  53.55 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  51.64 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  46.93 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  42.91 
 
 		 2167 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 520 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 508 aa  309  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 509 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  38.25 
 
 		 542 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 546 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  38.73 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 553 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 1453 aa  279  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.54 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2528  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.12 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.71 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 524 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 510 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 510 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 510 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 507 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.22 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.03 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 		 512 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  37.31 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 662 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 510 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 		 513 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.99 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 5154 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  35.37 
 
 		 1503 aa  243  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 495 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  33.65 
 
 		 1643 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 593 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 619 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 619 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.55 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.39 
 
 		 516 aa  237  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  33.14 
 
 		 593 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 619 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 619 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.97 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.94 
 
 		 622 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 502 aa  229  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.61 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 518 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  34.44 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 546 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  34.3 
 
 		 506 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 559 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  34.68 
 
 		 503 aa  226  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  34.83 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 557 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  35.43 
 
 		 509 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>