More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2528 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2528  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
342 aa  695    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
504 aa  484  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  60.58 
 
 
506 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  57.5 
 
 
506 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
512 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  49.19 
 
 
526 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 
526 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 
526 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
536 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  42.74 
 
 
535 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 
510 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  44.03 
 
 
513 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  47.47 
 
 
506 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  49.34 
 
 
511 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  47.15 
 
 
511 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  47.15 
 
 
511 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  40.69 
 
 
506 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
1453 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 
538 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  54.17 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  56.52 
 
 
537 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
539 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  45.93 
 
 
536 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
525 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
520 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
532 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  50.52 
 
 
534 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
485 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.78 
 
 
500 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  39.24 
 
 
534 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
619 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 
619 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  31.19 
 
 
619 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 
593 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
619 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  30.77 
 
 
593 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  34.32 
 
 
2167 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.57 
 
 
622 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  30.57 
 
 
504 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  48.96 
 
 
535 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  48.89 
 
 
534 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.67 
 
 
510 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10120  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
542 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.362122  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
533 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.56 
 
 
510 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.56 
 
 
510 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  31.2 
 
 
507 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  30.96 
 
 
507 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.83 
 
 
514 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.38 
 
 
518 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.12 
 
 
512 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.63 
 
 
491 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
511 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  52.08 
 
 
538 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 
564 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
530 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.14 
 
 
510 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.6 
 
 
504 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  32 
 
 
1643 aa  99.4  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  29.7 
 
 
510 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
530 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 
509 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  28.51 
 
 
510 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 
514 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  51.55 
 
 
539 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 
490 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
503 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
507 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  47.31 
 
 
539 aa  96.3  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  29.25 
 
 
504 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
509 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 
487 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  29.71 
 
 
504 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
770 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  28.11 
 
 
510 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
508 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
585 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 
509 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
525 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.42 
 
 
510 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
546 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  27.3 
 
 
504 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 
522 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.63 
 
 
538 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
517 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  46.53 
 
 
541 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 
524 aa  92.8  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
517 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.63 
 
 
538 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  30.05 
 
 
811 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
662 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  48.51 
 
 
546 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  26.32 
 
 
496 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 
494 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>