More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1852 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.16 
 
 
593 aa  1189    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  100 
 
 
593 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  89.6 
 
 
622 aa  1069    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.16 
 
 
619 aa  1192    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  99.16 
 
 
619 aa  1192    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  98.99 
 
 
619 aa  1188    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  99.66 
 
 
619 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 
520 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
525 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 
506 aa  298  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 
490 aa  280  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
509 aa  279  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  36.15 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
521 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
512 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
514 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
492 aa  264  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
662 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
546 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 
512 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 
499 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.19 
 
 
516 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
585 aa  256  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
495 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
503 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
509 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.37 
 
 
491 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
506 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
501 aa  247  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 
494 aa  246  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 
510 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.89 
 
 
510 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 
513 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
511 aa  244  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
506 aa  244  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 
510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 
510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
498 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
505 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 
510 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 
510 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 
510 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.39 
 
 
515 aa  242  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 
510 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.63 
 
 
510 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.43 
 
 
510 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
485 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.09 
 
 
514 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.24 
 
 
510 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
487 aa  237  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
569 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.93 
 
 
529 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.63 
 
 
503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  37.13 
 
 
506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.37 
 
 
514 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 
503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
539 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
500 aa  233  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
563 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
504 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
563 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
563 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
563 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
544 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
582 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 
575 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
561 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
527 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  30.81 
 
 
571 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 
561 aa  230  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 
582 aa  230  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
524 aa  230  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
502 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 
575 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
523 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
501 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.42 
 
 
500 aa  229  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
519 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
526 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
519 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
566 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
511 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
550 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
526 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
520 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
526 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.47 
 
 
561 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.64 
 
 
516 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 
571 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
549 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 
582 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.46 
 
 
510 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
508 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>