More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1692 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1692  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
560 aa  1162    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0924914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 
525 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
520 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
532 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
509 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
521 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
512 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 
514 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  39.24 
 
 
553 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
519 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
546 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
498 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 
553 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
527 aa  237  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.84 
 
 
515 aa  236  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  33.65 
 
 
508 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
662 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
512 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
521 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 
506 aa  230  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
495 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
508 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
518 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
511 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 
513 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 
508 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.64 
 
 
622 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.68 
 
 
529 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
508 aa  224  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
522 aa  223  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 
508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.13 
 
 
516 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 
508 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
494 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.06 
 
 
514 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
506 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
503 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
504 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
501 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1852  fatty-acid-CoA ligase  31.34 
 
 
593 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2157  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 
619 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0841  AMP-binding domain-containing protein  30.56 
 
 
619 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.46 
 
 
500 aa  213  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1456  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.07 
 
 
593 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.93 
 
 
503 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0430  AMP-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
619 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.56 
 
 
516 aa  213  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 
510 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0526  AMP-binding domain-containing protein  32.29 
 
 
619 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.7 
 
 
510 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
506 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.94 
 
 
534 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.94 
 
 
534 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.69 
 
 
491 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
506 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
569 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 
499 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 
485 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 
507 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 
492 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
548 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 
505 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
524 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 
585 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 
510 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
520 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
526 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  30.96 
 
 
512 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 
516 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
545 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 
526 aa  203  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  30.43 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
513 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 
551 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
564 aa  200  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
517 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 
553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.73 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>