More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6585 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6585  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 479 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  43.78 
 
 		 496 aa  354  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2126  AMP-dependent synthetase and ligase  47.12 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4032  AMP-dependent synthetase and ligase  46.37 
 
 		 501 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4355  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 475 aa  316  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  30.69 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  30.69 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 511 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  29.69 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  28.89 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  26.96 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  27.56 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 715 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.88 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.33 
 
 		 491 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 524 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 541 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2665  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535194  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  27.82 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.1 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  27.48 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  27.02 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  29.03 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 		 528 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2482  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 559 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  26.64 
 
 		 507 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  28.85 
 
 		 529 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 509 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 525 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 532 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.16 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.07 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.57 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  26.94 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.07 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.07 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  26.41 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  27.83 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  28.96 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 502 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.88 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  26.45 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  28.54 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 533 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.79 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.63 
 
 		 510 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 513 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 523 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  28.54 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.63 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.13 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  28.54 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  26.63 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.42 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.22 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4229  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  28.16 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>