More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4032 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4032  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 501 aa  963    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  54.49 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6585  AMP-dependent synthetase and ligase  46.28 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4355  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 		 475 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2126  AMP-dependent synthetase and ligase  46.53 
 
 		 470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  34.52 
 
 		 528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  33.01 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2665  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 521 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535194  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 		 529 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 517 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.27 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  32.58 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  34.26 
 
 		 503 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 502 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  29.29 
 
 		 521 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.33 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  29.24 
 
 		 521 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.43 
 
 		 526 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 511 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 		 521 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  31.97 
 
 		 523 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2717  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 544 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  32.07 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2482  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 559 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0632  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 715 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 525 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.54 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  28.26 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 504 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 546 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 504 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 514 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  27.33 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 503 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 518 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 518 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 504 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 516 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2871  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 521 aa  146  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.25 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 489 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  32.26 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 502 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0749  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  31.7 
 
 		 571 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.62 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>