276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2848 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  68.01 
 
 		 448 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  96.69 
 
 		 453 aa  909    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  100 
 
 		 453 aa  935    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  66.59 
 
 		 450 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  71.52 
 
 		 449 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  64.38 
 
 		 513 aa  614  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  52.41 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  52 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  49.45 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  47.11 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  47.11 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  41.54 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 472 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 472 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 472 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  41.65 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  41.21 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  40.8 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  33.68 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  38.73 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  44.69 
 
 		 189 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  26.21 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 		 918 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.32 
 
 		 918 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.32 
 
 		 918 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 1082 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.32 
 
 		 918 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.09 
 
 		 918 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.32 
 
 		 918 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.32 
 
 		 918 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.32 
 
 		 918 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.32 
 
 		 918 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.32 
 
 		 918 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.32 
 
 		 918 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.05 
 
 		 1082 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  26.79 
 
 		 1084 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.17 
 
 		 1102 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  25.82 
 
 		 1064 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.79 
 
 		 907 aa  83.2  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1739  SNF2-related protein  25.08 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  25.34 
 
 		 1084 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.73 
 
 		 1034 aa  82.4  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  23.3 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1066 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  24.11 
 
 		 1250 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  22.84 
 
 		 872 aa  80.5  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  25.97 
 
 		 1084 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  24.94 
 
 		 1064 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  24.94 
 
 		 1068 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  25.12 
 
 		 1064 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  25.12 
 
 		 1064 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  25.12 
 
 		 1064 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  25.12 
 
 		 1064 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  25.12 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  24.4 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  25.17 
 
 		 1064 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  24.88 
 
 		 1064 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  23.33 
 
 		 1086 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 1152 aa  74.3  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.73 
 
 		 1110 aa  74.3  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  24.83 
 
 		 1354 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 		 1089 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  23.01 
 
 		 1087 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  25.1 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  23.9 
 
 		 1125 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.55 
 
 		 1068 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  24.29 
 
 		 964 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  23.28 
 
 		 1178 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.52 
 
 		 933 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  23.12 
 
 		 886 aa  70.5  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 559 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.84 
 
 		 1181 aa  69.7  0.00000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  22.8 
 
 		 1032 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 		 1055 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 		 982 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 		 1108 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.46 
 
 		 1403 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  22.65 
 
 		 1386 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  21.57 
 
 		 1449 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 1112 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.29 
 
 		 1031 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  21.9 
 
 		 1021 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  23.01 
 
 		 1068 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  23.17 
 
 		 891 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.05 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.89 
 
 		 977 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  22.83 
 
 		 1159 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 		 1118 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  23.69 
 
 		 1071 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  24.25 
 
 		 1080 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 		 1028 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  23.21 
 
 		 1068 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  23.21 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  22.66 
 
 		 902 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  24.55 
 
 		 1006 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  24.93 
 
 		 1127 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.39 
 
 		 1113 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  21.1 
 
 		 1175 aa  63.9  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  21.97 
 
 		 1362 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>