286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1272 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  100 
 
 		 472 aa  973    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  100 
 
 		 472 aa  973    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  96.82 
 
 		 472 aa  946    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  98.94 
 
 		 472 aa  960    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  99.58 
 
 		 472 aa  968    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  96.21 
 
 		 470 aa  796    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  95.93 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  59.21 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  45.32 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  96.7 
 
 		 189 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  40.43 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  40.43 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  42.06 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  43.76 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.72 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  40.31 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 453 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  40.65 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  42.55 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 448 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1406  hypothetical protein  92.31 
 
 		 55 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  22.76 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.42 
 
 		 1082 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 		 1139 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  22.98 
 
 		 1125 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  26.58 
 
 		 1064 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 1112 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1102 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  24.85 
 
 		 1084 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  23.45 
 
 		 1077 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  25.9 
 
 		 1064 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  23.89 
 
 		 1087 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.39 
 
 		 1102 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  25.15 
 
 		 777 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  26.1 
 
 		 1048 aa  84  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  23.86 
 
 		 1071 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.75 
 
 		 1194 aa  83.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  25.8 
 
 		 1064 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  23.54 
 
 		 1084 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1481  hypothetical protein  95.56 
 
 		 45 aa  83.2  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  26.18 
 
 		 924 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  26.8 
 
 		 902 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 1118 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.07 
 
 		 918 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.07 
 
 		 918 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.74 
 
 		 1068 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  25.35 
 
 		 1073 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 		 925 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.47 
 
 		 1110 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.43 
 
 		 1069 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  24.21 
 
 		 1086 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 1091 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  24.81 
 
 		 1025 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 1073 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 1073 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 1073 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  21.46 
 
 		 1068 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  26.84 
 
 		 1096 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  24.6 
 
 		 1178 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.95 
 
 		 1089 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.44 
 
 		 918 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 		 1073 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.97 
 
 		 977 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  24.9 
 
 		 1161 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 1068 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  23.8 
 
 		 1070 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  23.95 
 
 		 1031 aa  73.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  23.92 
 
 		 918 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  25.62 
 
 		 985 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25.64 
 
 		 1141 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  23.38 
 
 		 1152 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  24.63 
 
 		 1081 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  24.1 
 
 		 1394 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  25.05 
 
 		 892 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  25 
 
 		 1112 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  23.45 
 
 		 1082 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  23.62 
 
 		 1082 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  22.68 
 
 		 773 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  23.87 
 
 		 872 aa  73.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  24.6 
 
 		 1163 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  25.61 
 
 		 1437 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.46 
 
 		 918 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 1068 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.11 
 
 		 1134 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 918 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  25.45 
 
 		 949 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  22.74 
 
 		 1154 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 876 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  23.4 
 
 		 809 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  33.12 
 
 		 1064 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  22.6 
 
 		 964 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  23.96 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  22.47 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>