251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1485 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  970    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  95.96 
 
 		 472 aa  794    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  98.99 
 
 		 472 aa  815    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  96.21 
 
 		 472 aa  796    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  96.21 
 
 		 472 aa  798    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  96.21 
 
 		 472 aa  798    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  97.26 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  55.84 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  99.45 
 
 		 189 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  45.12 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  40.85 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  41.98 
 
 		 457 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  42.93 
 
 		 454 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.99 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  40.95 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  43.07 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  40.15 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  40.1 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  40.8 
 
 		 453 aa  277  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  41.65 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1428  hypothetical protein  62.34 
 
 		 232 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1313  hypothetical protein  61.04 
 
 		 232 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1056  hypothetical protein  61.04 
 
 		 232 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0424492  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0423  hypothetical protein  61.04 
 
 		 240 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1332  hypothetical protein  61.76 
 
 		 223 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.519112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  24.32 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 1112 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  26.97 
 
 		 1064 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.34 
 
 		 1082 aa  76.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  25.82 
 
 		 1087 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.34 
 
 		 1102 aa  74.3  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  24.12 
 
 		 1125 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  24.55 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.45 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  26.05 
 
 		 1048 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25 
 
 		 1084 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  21.98 
 
 		 1139 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 1066 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 1068 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 1002 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  25.32 
 
 		 1064 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  32.45 
 
 		 872 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  24.57 
 
 		 1084 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  25.06 
 
 		 1064 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.29 
 
 		 902 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.71 
 
 		 918 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.71 
 
 		 918 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  23.86 
 
 		 1071 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  24.71 
 
 		 918 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  25.75 
 
 		 924 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2512  hypothetical protein  49.21 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 1152 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  21.95 
 
 		 1068 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  24.77 
 
 		 1178 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 925 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.35 
 
 		 977 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 1102 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.6 
 
 		 1069 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  32.69 
 
 		 1025 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 1082 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 1028 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 		 950 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.62 
 
 		 1034 aa  60.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.07 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 1090 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  25.44 
 
 		 1194 aa  60.1  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  28.81 
 
 		 1181 aa  59.7  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 1118 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.78 
 
 		 1110 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  31.52 
 
 		 1065 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.67 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.03 
 
 		 876 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  24.31 
 
 		 1031 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 918 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  27.49 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  24.95 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  29.73 
 
 		 1557 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 1089 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  23.84 
 
 		 918 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  29.15 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.35 
 
 		 1091 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  25.7 
 
 		 1006 aa  57  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  24.49 
 
 		 1394 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  26.17 
 
 		 902 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  31.07 
 
 		 1019 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 985 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  24.38 
 
 		 980 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  29.94 
 
 		 1259 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 1069 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>