More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1739 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1739  SNF2-related protein  100 
 
 		 375 aa  761    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.78 
 
 		 1068 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.94 
 
 		 1082 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.88 
 
 		 1181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  27 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 1091 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  26.38 
 
 		 1068 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.99 
 
 		 977 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0608  hypothetical protein  26.32 
 
 		 514 aa  109  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.901786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 1104 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 		 1069 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  23.6 
 
 		 985 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 		 982 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  25.38 
 
 		 1071 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 1068 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 1171 aa  103  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  23.35 
 
 		 1284 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 933 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  25.19 
 
 		 1087 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  27.46 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  25.48 
 
 		 924 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  24.63 
 
 		 1386 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  25.67 
 
 		 1003 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  25.89 
 
 		 1086 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.81 
 
 		 1102 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  25 
 
 		 1175 aa  97.1  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  28.77 
 
 		 1077 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  24.46 
 
 		 1222 aa  96.3  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  24.63 
 
 		 1362 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 1113 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 1139 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  23.66 
 
 		 1113 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  24.05 
 
 		 1086 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 1068 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.06 
 
 		 925 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  23.37 
 
 		 1031 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  26.5 
 
 		 1062 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  25 
 
 		 1250 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  25.87 
 
 		 513 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  25.26 
 
 		 1084 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  24.63 
 
 		 1080 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  24.2 
 
 		 1112 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 1261 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 1066 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  23.63 
 
 		 1357 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.77 
 
 		 1091 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  23.69 
 
 		 922 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 		 1068 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  23.99 
 
 		 1064 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  26.14 
 
 		 1100 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  23.04 
 
 		 726 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  24.86 
 
 		 970 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  24.44 
 
 		 1064 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  24.7 
 
 		 1194 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  25.21 
 
 		 964 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  25.77 
 
 		 1437 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  22.94 
 
 		 621 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  24.56 
 
 		 914 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  23.11 
 
 		 1078 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  24.11 
 
 		 1531 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  24.19 
 
 		 1064 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  24.19 
 
 		 1064 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  24.19 
 
 		 1064 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  24.19 
 
 		 1064 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  24.31 
 
 		 1064 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  23.7 
 
 		 1354 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  24.19 
 
 		 1064 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  21.34 
 
 		 1002 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.45 
 
 		 907 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  23.69 
 
 		 1064 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  23.77 
 
 		 918 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  20.56 
 
 		 617 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  21.48 
 
 		 777 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  23.8 
 
 		 1178 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  23.47 
 
 		 872 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  24.26 
 
 		 1072 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.7 
 
 		 895 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  24.84 
 
 		 454 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  24.27 
 
 		 872 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  22.06 
 
 		 891 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  22.33 
 
 		 1108 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.65 
 
 		 1403 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 1118 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 1082 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  24.81 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  26.44 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  22.25 
 
 		 988 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  24.81 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  24.81 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.81 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 		 1129 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 876 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.81 
 
 		 918 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  24.94 
 
 		 918 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  25.56 
 
 		 1125 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  23.04 
 
 		 1069 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  23.76 
 
 		 1013 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  21.73 
 
 		 1055 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.56 
 
 		 918 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 966 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>