113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1183 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  610  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  98.98 
 
 		 472 aa  603  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  95.93 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  95.93 
 
 		 472 aa  586  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  95.56 
 
 		 472 aa  580  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  95.25 
 
 		 472 aa  580  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  97.26 
 
 		 470 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  63.83 
 
 		 463 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  47.83 
 
 		 477 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  40.21 
 
 		 457 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  41.94 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  42.45 
 
 		 449 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  37.37 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  37.37 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  42.97 
 
 		 513 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  36.71 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.4 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  37.81 
 
 		 453 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  38.73 
 
 		 453 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  44.08 
 
 		 448 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1406  hypothetical protein  92.31 
 
 		 55 aa  96.3  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1481  hypothetical protein  95.56 
 
 		 45 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  22.22 
 
 		 452 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 1089 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 1120 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.11 
 
 		 1082 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1088 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1088 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  28 
 
 		 1209 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25.09 
 
 		 1084 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 1102 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  32.29 
 
 		 809 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  24.82 
 
 		 1084 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  25.64 
 
 		 1086 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  25.88 
 
 		 872 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27.61 
 
 		 1088 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  29.31 
 
 		 1096 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  24.69 
 
 		 663 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  25.31 
 
 		 918 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  24.69 
 
 		 914 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  24.85 
 
 		 773 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.14 
 
 		 1227 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  27.37 
 
 		 777 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  32.61 
 
 		 991 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  25.15 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 		 1091 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  27.12 
 
 		 1141 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  25.15 
 
 		 1070 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  25.16 
 
 		 1091 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  24.68 
 
 		 1086 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  19.12 
 
 		 1139 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  25.62 
 
 		 1100 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  24.54 
 
 		 1082 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 1118 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  23.48 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 		 1073 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 876 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.9 
 
 		 1354 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  24.54 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  24.54 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  23.08 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  24.36 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 931 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 		 1069 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  21.15 
 
 		 1150 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26.38 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  22 
 
 		 715 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  23.83 
 
 		 1394 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.38 
 
 		 1110 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 848 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 1155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  26.01 
 
 		 1178 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  25.77 
 
 		 1064 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  21.38 
 
 		 1134 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  23.18 
 
 		 1048 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  22.52 
 
 		 1154 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  29.35 
 
 		 903 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 922 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 1113 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  23.53 
 
 		 1113 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  23.81 
 
 		 868 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  25.96 
 
 		 1202 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 		 1765 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  26.63 
 
 		 902 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  25.6 
 
 		 1031 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 1066 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 		 1108 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  24.61 
 
 		 924 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  24.85 
 
 		 1064 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.23 
 
 		 1160 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25 
 
 		 1102 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.44 
 
 		 1068 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>