148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4929 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4929  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 490 aa  998    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.36 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3181  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.65 
 
 		 254 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 		 2240 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.97 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.29 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 291 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 		 1694 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 789 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 1737 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 734 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 251 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 4079 aa  54.3  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 927 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.79 
 
 		 264 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1096 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 292 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1276 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 289 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 699 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.83 
 
 		 730 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  25.58 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.81 
 
 		 784 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1297 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25 
 
 		 1676 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 288 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 767 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.33 
 
 		 733 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 707 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 287 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 878 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 374 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3145 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  25.57 
 
 		 508 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 289 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 329 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 1013 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1049 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 		 267 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.97 
 
 		 810 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 266 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 565 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  19.43 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 879 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.69 
 
 		 764 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.6 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.6 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  19.54 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.44 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 376 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 265 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 2651 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 796 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 		 614 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.76 
 
 		 832 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.43 
 
 		 661 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.17 
 
 		 758 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.07 
 
 		 622 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 543 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  20.25 
 
 		 573 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 3172 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 286 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30 
 
 		 668 aa  47.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  28.06 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 711 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 715 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  19.72 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.3 
 
 		 707 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1276 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 934 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  30.3 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.3 
 
 		 836 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  22.44 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  18.32 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.98 
 
 		 1979 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 317 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>