More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1658 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1658  DEAD box-related helicase (ATP-dependent RNA helicase)  100 
 
 		 437 aa  899    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.04 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3971  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.568065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.42 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_002950  PG2099  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.42 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1766  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.59 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3506  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.24 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.81 
 
 		 429 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3388  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.05 
 
 		 409 aa  307  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.48 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  37.56 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1330  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3058  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.58 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.06 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2718  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1296  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.81 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 		 409 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2800  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.28 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0135587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.7 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.91 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.75 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3005  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.99 
 
 		 445 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.46 
 
 		 471 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.27 
 
 		 418 aa  299  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.41 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.79 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  37.44 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.31 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.14 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.32 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.44 
 
 		 583 aa  296  6e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1363  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 		 472 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1337  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 		 472 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1327  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.67 
 
 		 456 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3021  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.66 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2571  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.21 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.26 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.41 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.92 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  39.5 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  39.73 
 
 		 579 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.42 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.74 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.46 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.46 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.58 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.46 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.46 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.46 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3364  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.12 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 454 aa  292  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  36.3 
 
 		 432 aa  292  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  38.21 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.21 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.02 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  38.58 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.21 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.43 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  38.21 
 
 		 454 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  36.67 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 480 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.64 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  36.39 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.37 
 
 		 590 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1254  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.58 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.85 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.35 
 
 		 540 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 532 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 		 480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  37.8 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 486 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 		 467 aa  289  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  38.11 
 
 		 561 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.29 
 
 		 492 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 		 479 aa  289  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  38.32 
 
 		 486 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 		 486 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.69 
 
 		 452 aa  289  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 		 435 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  38.32 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.96 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.96 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>