109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0623 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0623  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0332957 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1817  hypothetical protein  48.15 
 
 		 679 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2121  hypothetical protein  48.15 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0487  putative oxygenase  48.15 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0804  oxygenase  48.15 
 
 		 342 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0389  putative oxygenase  47.84 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1002  hypothetical protein  48.86 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0331823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2106  hypothetical protein  48.86 
 
 		 349 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.588734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2051  hypothetical protein  48.57 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2245  hypothetical protein  48.29 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2330  hypothetical protein  47.71 
 
 		 349 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2123  hypothetical protein  56.41 
 
 		 84 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  28.24 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.15 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  30.71 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.68 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  35.85 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  28.85 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  24.77 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  27.4 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  25.12 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  24.58 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.29 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  32.08 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  36.67 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  25.87 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.23 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  23.51 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  24.77 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.75 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.75 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  33.6 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.96 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  36.84 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  22.22 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.75 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.91 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  23.23 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  29.17 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  22.22 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  24.62 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  22.27 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  22.81 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  26.35 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  33.64 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  31.91 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  41.1 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  34.69 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  36.84 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.02 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  35.14 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  42.47 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  31.37 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  38.16 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  24.7 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.7 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.24 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  29.82 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  27.69 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  30.77 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.7 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  26.04 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  29.36 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  33.9 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  36.99 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  21.25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  20.35 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  37.63 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  36.49 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  29.81 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  38.96 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.08 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  39.81 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  29.6 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  23.35 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  31.91 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  30.63 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  34.25 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  26.67 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.35 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  21.3 
 
 		 388 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  33.71 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.45 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2122  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  27.56 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  30.14 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.138524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>