131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2106 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1002  hypothetical protein  99.14 
 
 		 349 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0331823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.588734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2245  hypothetical protein  97.71 
 
 		 346 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2051  hypothetical protein  97.99 
 
 		 347 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2330  hypothetical protein  85.21 
 
 		 349 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1817  hypothetical protein  69.05 
 
 		 679 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2121  hypothetical protein  69.05 
 
 		 345 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0487  putative oxygenase  69.05 
 
 		 345 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0389  putative oxygenase  69.05 
 
 		 345 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0804  oxygenase  69.48 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0623  hypothetical protein  48.86 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0332957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2123  hypothetical protein  73.75 
 
 		 84 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  25.72 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  25.17 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  34.81 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.99 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.11 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2122  hypothetical protein  82 
 
 		 51 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.74 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  27.14 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.56 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  32.02 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  24.91 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  31.11 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  42.27 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.33 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.3 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  23.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.24 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  25.51 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  32.93 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  25.93 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  35.51 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.69 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  25.5 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.41 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  33.08 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.47 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.65 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.69 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  24.7 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  24.7 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  25.85 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  25.7 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  29.92 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  36 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  24.09 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  28 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  36 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.28 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  28 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  28.33 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  35.51 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  35.56 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  39.47 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  36.9 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  31.78 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  33.65 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  27.16 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.49 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  30.71 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  24.51 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  30.2 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  30.69 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.15 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  25.98 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.14 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  43.84 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  37.36 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  40.26 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.94 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.48 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  21.22 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  31.78 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  22.49 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  28.18 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  27.71 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.78 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  33.78 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  40.78 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  28.49 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  28.43 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  30.48 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  36.76 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.11 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>