More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7002 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7002  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  253  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6016  LysR family transcriptional regulator  74.12 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.234524  normal  0.324273 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5415  LysR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268248  normal  0.063315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3835  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  53.16 
 
 		 329 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 307 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6558  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3512  LysR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4354  LysR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294193  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4012  LysR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 292 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2071  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152611  normal  0.829047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 292 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6559  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  45.35 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6200  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  39.78 
 
 		 310 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.9 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1807  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 305 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.625247  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.75 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0754  LysR substrate-binding  38.38 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  34.94 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.55 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  34.86 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3183  LysR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3209  LysR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 320 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 299 aa  53.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  43.21 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  39.74 
 
 		 302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  39.74 
 
 		 302 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3205  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 314 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2275  transcriptional regulator, LysR family protein  35 
 
 		 289 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0234107  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 314 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3422  LysR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.803212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 305 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  39.74 
 
 		 302 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 299 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 304 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 330 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  41.25 
 
 		 297 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  33.03 
 
 		 303 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 330 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 343 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>