More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3183 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3183  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2160  LysR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 375 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 314 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 309 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3013  LysR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 307 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  51.85 
 
 		 335 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2354  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 301 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 297 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  49.38 
 
 		 301 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  56.52 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3567  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.38 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  43.16 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  47.78 
 
 		 300 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 294 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 304 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 299 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2207  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 301 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 313 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  56.52 
 
 		 302 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 298 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0607  LysR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 310 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.822767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0547  LysR family substrate binding transcriptional regulator  47.5 
 
 		 318 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  38.71 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2713  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  46.25 
 
 		 305 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 304 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  44.57 
 
 		 305 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 298 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 296 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  41.98 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  45.65 
 
 		 306 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1453  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245506  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  48.05 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  50.63 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 298 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 295 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 303 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 298 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  48.05 
 
 		 300 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  46.34 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  44.83 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2618  putative HTH-type transcriptional regulator YafC  47.5 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  43.75 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  52.94 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 308 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1178  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237766  hitchhiker  0.000914509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0482  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  51.25 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1406  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 299 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 316 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>