More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1178 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1178  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237766  hitchhiker  0.000914509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0482  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.67 
 
 		 303 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.02 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4393  putative DNA-binding transcriptional regulator  88.45 
 
 		 303 aa  567  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0261  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.87 
 
 		 311 aa  527  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0270  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.46 
 
 		 314 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3828  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.87 
 
 		 314 aa  517  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3680  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.53 
 
 		 308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03103  predicted DNA-binding transcriptional regulator, efflux system  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3726  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03054  hypothetical protein  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3275  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 		 309 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3539  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4560  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.73 
 
 		 309 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3559  putative DNA-binding transcriptional regulator  79 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3670  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.57 
 
 		 314 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3630  putative DNA-binding transcriptional regulator  79 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0429881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3727  putative DNA-binding transcriptional regulator  79 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3665  putative DNA-binding transcriptional regulator  79 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.99326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3558  putative DNA-binding transcriptional regulator  79 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.85 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02101  probable transcriptional regulator, LysR family protein  34.24 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  34.71 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3137  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2745  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2609  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  31.86 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3690  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  31.79 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0928  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0490463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>