More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0270 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0270  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
314 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0261  putative DNA-binding transcriptional regulator  91.64 
 
 
311 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3828  putative DNA-binding transcriptional regulator  87.75 
 
 
314 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3670  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.79 
 
 
314 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4393  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.77 
 
 
303 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1178  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.46 
 
 
303 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237766  hitchhiker  0.000914509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0482  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.46 
 
 
303 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.13 
 
 
303 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3680  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.4 
 
 
308 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3558  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 
309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3559  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 
309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3630  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 
309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0429881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3727  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 
309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.107486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3665  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.4 
 
 
309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.99326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03103  predicted DNA-binding transcriptional regulator, efflux system  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3726  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3539  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4560  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550103  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03054  hypothetical protein  81 
 
 
309 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3275  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.67 
 
 
309 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
293 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
307 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
296 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
298 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
322 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.65 
 
 
307 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
298 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
295 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
295 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  31.62 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
298 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  34.81 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 
298 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
313 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
303 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3351  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  32.23 
 
 
306 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.545822  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
303 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
297 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
301 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
297 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
300 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 
335 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 
300 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
313 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  32.11 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
307 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  35.29 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.63 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 
305 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
309 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
301 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
305 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 
300 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
306 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 
300 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.06 
 
 
297 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
342 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
298 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 
302 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
301 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 
311 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
313 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
303 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
304 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
298 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
303 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
312 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
298 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
302 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
325 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
302 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>