More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2206 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  46.02 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1453  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245506  normal  0.0938109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1056  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000324577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1406  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4580  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3680  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.41 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03103  predicted DNA-binding transcriptional regulator, efflux system  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3665  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.72 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.99326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3726  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3559  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.72 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3630  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.72 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0429881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3539  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0482  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3727  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.72 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4560  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1178  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.84 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237766  hitchhiker  0.000914509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03054  hypothetical protein  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3558  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.72 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3275  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.02 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3839  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3252  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  34.03 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0969  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.03 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1021  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4393  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0270  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.93 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0261  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3670  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3828  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.25 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.27 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3488  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2198  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.36 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 307 aa  158  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3627  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0934  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  30.18 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0990  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3351  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  29.87 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.545822  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.57 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  30.24 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1323  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3407  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.03 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1605  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.25782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000935  LysR-family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0375861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>