More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2160 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2160  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 375 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 314 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37120  LysR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0187077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3013  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 301 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.82 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.93 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  35.08 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  38.36 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2270  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.12 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5619  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.272511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.42 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  38.8 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 295 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 306 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.63 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1245  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 317 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1990  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 299 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 301 aa  177  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6075  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 298 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1665  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 296 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 299 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 303 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  34.8 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5211  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  34.22 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3373  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 309 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2741  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  33.68 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>