More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2478 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  593  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2354  LysR family transcriptional regulator  84.56 
 
 		 301 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.373464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2207  LysR family transcriptional regulator  83.5 
 
 		 301 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3567  LysR family transcriptional regulator  82.49 
 
 		 301 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03790  Transcriptional regulator, LysR family  57.33 
 
 		 301 aa  341  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2450  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 301 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 301 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2390  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5499  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0853142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5764  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  43.88 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 310 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1985  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3459  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  34.24 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4725  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.12 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1399  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0678  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2411  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  33.11 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.26 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>