More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5415 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5415  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268248  normal  0.063315 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7002  LysR family transcriptional regulator  75.58 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6016  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.234524  normal  0.324273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3835  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 329 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6189  transcriptional regulator, LysR family  49.02 
 
 		 329 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6239  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 307 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6523  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.714407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2071  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152611  normal  0.829047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6558  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 301 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4012  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3512  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4354  LysR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.294193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 300 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 300 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  43.53 
 
 		 293 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  43.75 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6559  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  43.75 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2349  fhu operon transcription regulator  31.76 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0472419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 312 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1807  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.625247  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0754  LysR substrate-binding  38.3 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 306 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000622  transcriptional regulator  35 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  37.97 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3209  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2138  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2618  putative HTH-type transcriptional regulator YafC  41.77 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.76 
 
 		 305 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 311 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 313 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05602  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1015  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 311 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.688296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 323 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 297 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0058  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4623  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.570776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 298 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 318 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 299 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0086  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 295 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4949  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 308 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 305 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 313 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 305 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3422  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 288 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.803212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3449  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 298 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 303 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>