More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3321 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  77.7 
 
 		 300 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  67.69 
 
 		 301 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  66.22 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 314 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  51.19 
 
 		 295 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.66 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  46.6 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 335 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 415 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  45.49 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 323 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  45.97 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  43.28 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  43.24 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  43.24 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  43.58 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  40.34 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>