More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3443 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  77.7 
 
 		 306 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  71.77 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  69.36 
 
 		 301 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  53.06 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.35 
 
 		 305 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  51.01 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  51.02 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 338 aa  285  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 298 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  48.48 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  46.88 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 303 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  44.19 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 297 aa  261  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 299 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 298 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  43.73 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  43.73 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  44.07 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 327 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 435 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 415 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  40.94 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>