More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2138 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2138  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2438  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  49.5 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 313 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1380  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  45.82 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  46.98 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  42.47 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1665  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0884032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.96 
 
 		 305 aa  245  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3953  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  41.06 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  42.14 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  43.62 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  40.47 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  42.28 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  41.61 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  41.61 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  39.6 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>