More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1665 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1665  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0884032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  43.92 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2438  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1380  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  38.98 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  41.81 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2138  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 313 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  41.86 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  39.67 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 334 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3953  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 327 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  39.07 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 323 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 428 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 415 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 435 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  38.05 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>