More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1015 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1015  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.688296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 298 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  60.47 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 297 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  60.13 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  60.14 
 
 		 288 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3449  LysR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 298 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  53.12 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 300 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  52.2 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1052  transcriptional regulator, LysR family  51.39 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2231  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  48.3 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.34 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 301 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  43.88 
 
 		 315 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 338 aa  242  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 415 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 428 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 435 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>