More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0938 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4159  porin  96.27 
 
 
409 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  95.27 
 
 
402 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  95.52 
 
 
402 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
402 aa  807    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  95.52 
 
 
402 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  95.52 
 
 
402 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  89.55 
 
 
401 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  80.37 
 
 
400 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  79.79 
 
 
400 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  79.52 
 
 
400 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  79.52 
 
 
400 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  79.52 
 
 
412 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  79.52 
 
 
400 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  78.99 
 
 
400 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  79.26 
 
 
400 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  58 
 
 
404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  58.9 
 
 
405 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  59.01 
 
 
409 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.9 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.9 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.18 
 
 
436 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.18 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.18 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.18 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.04 
 
 
383 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.18 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.18 
 
 
386 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.35 
 
 
385 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.1 
 
 
385 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.15 
 
 
383 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.92 
 
 
386 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.92 
 
 
436 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  40.82 
 
 
389 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.56 
 
 
389 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.5 
 
 
389 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  38.82 
 
 
391 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.12 
 
 
383 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.78 
 
 
383 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  40.53 
 
 
409 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  40.53 
 
 
409 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.01 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.56 
 
 
391 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  39.65 
 
 
402 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.34 
 
 
379 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  37.56 
 
 
398 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  38.5 
 
 
380 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  37.98 
 
 
380 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.14 
 
 
384 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  36.14 
 
 
395 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  37.98 
 
 
384 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  35.15 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  35.81 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  37.47 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  36.21 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  37.47 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  37.47 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  38.86 
 
 
375 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  36.05 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  36.05 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.91 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.66 
 
 
383 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  37.91 
 
 
374 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.01 
 
 
384 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  37.08 
 
 
400 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  35.81 
 
 
394 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  37.32 
 
 
391 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.5 
 
 
375 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.5 
 
 
375 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  37.21 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.41 
 
 
389 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.86 
 
 
384 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  36.39 
 
 
387 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  37.01 
 
 
381 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  36.73 
 
 
394 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  37.47 
 
 
384 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  36.95 
 
 
414 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.11 
 
 
375 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  37.21 
 
 
384 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  34.99 
 
 
366 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.08 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  36.2 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.08 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.08 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  37.8 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  38.48 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.08 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  35.31 
 
 
396 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  36.95 
 
 
384 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  36.25 
 
 
386 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  37.8 
 
 
383 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  36.87 
 
 
383 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.08 
 
 
399 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36 
 
 
387 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>