More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0948 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  100 
 
 
400 aa  801    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  100 
 
 
400 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  99.5 
 
 
400 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  100 
 
 
412 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  100 
 
 
400 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  99.75 
 
 
400 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  88.75 
 
 
400 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  99.5 
 
 
400 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  77.84 
 
 
402 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  76.57 
 
 
402 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4159  porin  75.37 
 
 
409 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  77.84 
 
 
401 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  75.57 
 
 
402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  75.57 
 
 
402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  75.31 
 
 
402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  59.27 
 
 
404 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  58.79 
 
 
405 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  57.44 
 
 
409 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.46 
 
 
436 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.16 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.16 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.16 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.16 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.16 
 
 
386 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.01 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.01 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.46 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.52 
 
 
383 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.77 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  38.9 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.84 
 
 
385 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.59 
 
 
385 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  40.46 
 
 
389 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.77 
 
 
379 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.09 
 
 
389 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  36.72 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  37.84 
 
 
408 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.7 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  39.34 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.95 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.92 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  36.3 
 
 
391 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.68 
 
 
389 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  37.5 
 
 
379 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  35.45 
 
 
387 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  37.02 
 
 
377 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  36.32 
 
 
398 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.53 
 
 
383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  34.77 
 
 
383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  36.59 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.4 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  34.55 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.71 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.39 
 
 
384 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  35.75 
 
 
395 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  37.06 
 
 
400 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  36.7 
 
 
409 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  36.7 
 
 
409 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  36.6 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  36.6 
 
 
375 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  36.89 
 
 
389 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  34.88 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  36.26 
 
 
389 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  37.9 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  37.9 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  37.9 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  37.9 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  35.66 
 
 
380 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.9 
 
 
399 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  36.21 
 
 
391 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  36.56 
 
 
381 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  34.95 
 
 
384 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  35.66 
 
 
380 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.18 
 
 
387 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  37.9 
 
 
391 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  35.73 
 
 
381 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.34 
 
 
375 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  38.11 
 
 
352 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  36.5 
 
 
377 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  35.15 
 
 
394 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  34.8 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  35.15 
 
 
394 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.04 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  35.15 
 
 
394 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  34.76 
 
 
366 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  34.8 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  34.8 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  34.8 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  34.8 
 
 
379 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  33.9 
 
 
397 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  33.65 
 
 
421 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  33.65 
 
 
421 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  34.76 
 
 
394 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  35.46 
 
 
391 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  34.84 
 
 
394 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  35.46 
 
 
445 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.44 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  36.1 
 
 
375 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.75 
 
 
388 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.44 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>