More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3816 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3816  porin  100 
 
 		 409 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  75.31 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  58.77 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  57.43 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  57.21 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  59.01 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  57.21 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4159  porin  58.49 
 
 		 409 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  56.97 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  57.99 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  57.37 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  57.37 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  57.37 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  57.37 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  57.37 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  57.37 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  57.11 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  57.37 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.25 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.25 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.17 
 
 		 389 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  40.49 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.52 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.65 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.45 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.9 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  38.4 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  38.4 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  38.57 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  38.57 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  38.57 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.57 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  38.57 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  38.57 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  39.81 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.53 
 
 		 378 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  38.96 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.92 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  38.33 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.76 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  40.2 
 
 		 375 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  39.8 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  40.2 
 
 		 375 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.57 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  39.32 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  37.93 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  40.2 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.25 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  40.24 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.75 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.59 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  39.23 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  37.97 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.44 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40.29 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.41 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  36.63 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.01 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.75 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.59 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  39.55 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.62 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  38.69 
 
 		 386 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  39.55 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  38.2 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  38.06 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  37.4 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  39.9 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.34 
 
 		 381 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  39.74 
 
 		 380 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  38.04 
 
 		 386 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  38.42 
 
 		 394 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  38.42 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  37.6 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  38.42 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  38.26 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  38.26 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  38.79 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  38.01 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.54 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  38.11 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  36.96 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  36.96 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  38.01 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  35.94 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  38.01 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  35.94 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  38.01 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  35.94 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  35.94 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.64 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.05 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  37.53 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  39.49 
 
 		 380 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>