More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1532 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  88.75 
 
 
400 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
400 aa  802    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  88.75 
 
 
400 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  88.75 
 
 
400 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  88.75 
 
 
400 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  88.75 
 
 
412 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  88.5 
 
 
400 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  88.5 
 
 
400 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  77.61 
 
 
402 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  75.87 
 
 
402 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  78.29 
 
 
401 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  76.12 
 
 
402 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4159  porin  76.87 
 
 
409 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  75.62 
 
 
402 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  75.87 
 
 
402 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  59.69 
 
 
405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  58.75 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  57.44 
 
 
409 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.82 
 
 
436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.82 
 
 
436 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  38.77 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.05 
 
 
383 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.4 
 
 
383 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.4 
 
 
383 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.8 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  39.85 
 
 
385 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.6 
 
 
385 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  38.11 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.95 
 
 
389 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  38.63 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  37.99 
 
 
389 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  38.88 
 
 
391 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  38.34 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.43 
 
 
389 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  37.56 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.14 
 
 
383 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  39.03 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  37.35 
 
 
387 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  36.08 
 
 
396 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  38.27 
 
 
402 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  37.98 
 
 
380 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  37.94 
 
 
398 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  37.98 
 
 
380 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  38.75 
 
 
400 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  36.43 
 
 
394 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  36.43 
 
 
394 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  36.43 
 
 
394 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  36.43 
 
 
394 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.54 
 
 
389 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  37.25 
 
 
409 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  37.25 
 
 
409 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  37.4 
 
 
384 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  37.95 
 
 
377 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  38.57 
 
 
389 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37.01 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  37.47 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  36.6 
 
 
394 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  36.34 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  36.6 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.85 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  36.62 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.01 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  37.03 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  36.09 
 
 
378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  37.67 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  37.67 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  38.98 
 
 
380 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  37.67 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  37.67 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  35.68 
 
 
383 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  37.67 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  41.29 
 
 
372 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.25 
 
 
380 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  36.06 
 
 
396 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  37.84 
 
 
400 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  38.08 
 
 
400 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  36.73 
 
 
375 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  38.89 
 
 
363 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  37.95 
 
 
377 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.32 
 
 
384 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36.72 
 
 
381 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  37.9 
 
 
391 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.64 
 
 
385 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  35.55 
 
 
384 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  36.32 
 
 
414 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.77 
 
 
381 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  36.6 
 
 
375 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  36.6 
 
 
375 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.25 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>