More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1356 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  99.74 
 
 		 1174 aa  779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1356  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  100 
 
 		 389 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  84.52 
 
 		 1176 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2232  DNA polymerase III subunit alpha  84.44 
 
 		 1190 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  99.74 
 
 		 1174 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 1274 aa  782    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  95.12 
 
 		 1278 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  99.74 
 
 		 1174 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 1174 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  84.44 
 
 		 1177 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  84.44 
 
 		 1177 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  84.44 
 
 		 1177 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  99.74 
 
 		 1686 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2336  DNA polymerase III subunit alpha  84.18 
 
 		 1175 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.0606341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0964  DNA polymerase III subunit alpha  83.5 
 
 		 1179 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2079  DNA polymerase III subunit alpha  77.25 
 
 		 1187 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0447418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1253  DNA polymerase III subunit alpha  74.01 
 
 		 1192 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  74.88 
 
 		 1193 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  58.04 
 
 		 1176 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  58.17 
 
 		 1175 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2008  DNA polymerase III subunit alpha  59.02 
 
 		 1172 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244656  normal  0.455713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2403  DNA polymerase III subunit alpha  59.02 
 
 		 1172 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  56.93 
 
 		 1173 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  46.04 
 
 		 1149 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  45.64 
 
 		 1156 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  45.59 
 
 		 1174 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1249  DNA polymerase III, alpha subunit  45.32 
 
 		 1205 aa  312  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.456819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0606  DNA polymerase III, alpha subunit  44.88 
 
 		 1204 aa  311  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  44.19 
 
 		 1141 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1583  DNA polymerase III, alpha subunit  46.08 
 
 		 1174 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2252  DNA polymerase III, alpha subunit  42.39 
 
 		 1174 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.353528  normal  0.94108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  41.02 
 
 		 1185 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 		 1190 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1898  DNA polymerase III, alpha subunit  42.34 
 
 		 1179 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  42.34 
 
 		 1187 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0980  DNA polymerase III, alpha subunit  42.19 
 
 		 1188 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  44.36 
 
 		 1173 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  41.27 
 
 		 1186 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3501  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1194 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3118  DNA polymerase III, alpha subunit  42.03 
 
 		 1172 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  41.96 
 
 		 1190 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  40.69 
 
 		 1165 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  38 
 
 		 1168 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1157 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1157 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2887  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1157 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0886013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1157 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  36.16 
 
 		 1157 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  35.68 
 
 		 1158 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  35.93 
 
 		 1157 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  35.68 
 
 		 1177 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  34.92 
 
 		 1158 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  34.92 
 
 		 1158 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  34.92 
 
 		 1158 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  37.74 
 
 		 1176 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  36.59 
 
 		 1162 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1287  DNA polymerase III, alpha subunit  33.92 
 
 		 1158 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  35.34 
 
 		 1157 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  39.41 
 
 		 1162 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.92 
 
 		 1173 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  35.09 
 
 		 1157 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.38 
 
 		 1173 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  37.92 
 
 		 1185 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  34.17 
 
 		 1157 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  34.78 
 
 		 1159 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  36.72 
 
 		 1143 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  35.18 
 
 		 1148 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.59 
 
 		 1173 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  33.67 
 
 		 1158 aa  222  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  35.98 
 
 		 1159 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3775  DNA polymerase III subunit alpha  35.47 
 
 		 1162 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  34.42 
 
 		 1148 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  35.35 
 
 		 1173 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  35.93 
 
 		 1182 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  34.78 
 
 		 1174 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  35.4 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  34.78 
 
 		 1174 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  35.4 
 
 		 1160 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  35.4 
 
 		 1160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  35.43 
 
 		 1159 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  35.4 
 
 		 1160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  35.4 
 
 		 1160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.23 
 
 		 1158 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  36.5 
 
 		 1164 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  35.15 
 
 		 1160 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1160 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  35.57 
 
 		 1159 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  33.82 
 
 		 1174 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  34.87 
 
 		 1173 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  34.9 
 
 		 1171 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  34.9 
 
 		 1160 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>