92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6696 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6696  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  724    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 1421 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 778 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  21.28 
 
 		 745 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  28.8 
 
 		 672 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  25.57 
 
 		 695 aa  53.1  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.33 
 
 		 738 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 615 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.54 
 
 		 1979 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.66 
 
 		 746 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 649 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 3560 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 629 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.17 
 
 		 706 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 608 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0624  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 827 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  25.63 
 
 		 581 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  27.12 
 
 		 612 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 528 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 458 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 515 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.06 
 
 		 1240 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.59 
 
 		 706 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  28.45 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 		 541 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1276 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.31 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  30.89 
 
 		 929 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  30.08 
 
 		 767 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.55 
 
 		 1056 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  31.29 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 786 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1094 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  32.59 
 
 		 640 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.36 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.49 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.24 
 
 		 635 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  27.22 
 
 		 668 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 		 818 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 4079 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  22.81 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 732 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3379  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 634 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  22.81 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  20.17 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  22.98 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  30.43 
 
 		 518 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0516  hypothetical protein  32.05 
 
 		 162 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.643941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.63 
 
 		 582 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 		 616 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2046  tetratricopeptide protein  23.4 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000249019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>