194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00022 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00021  putative usher protein  100 
 
 		 381 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.102676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00022  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  687    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  61.68 
 
 		 829 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  61.68 
 
 		 829 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  59.88 
 
 		 826 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  58.98 
 
 		 826 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  58.68 
 
 		 826 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  58.68 
 
 		 826 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  58.68 
 
 		 826 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  58.38 
 
 		 826 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  49.7 
 
 		 828 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  49.7 
 
 		 828 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  49.7 
 
 		 828 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.44 
 
 		 836 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.01 
 
 		 861 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  29.63 
 
 		 901 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.63 
 
 		 901 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.19 
 
 		 851 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  29.31 
 
 		 842 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.71 
 
 		 866 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  27.61 
 
 		 870 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.61 
 
 		 870 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.48 
 
 		 819 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.36 
 
 		 929 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.83 
 
 		 850 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  27.14 
 
 		 844 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.67 
 
 		 963 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.67 
 
 		 1040 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.57 
 
 		 852 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  27.41 
 
 		 868 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 872 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.38 
 
 		 887 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  27.93 
 
 		 853 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.17 
 
 		 867 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  27.65 
 
 		 853 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  27.65 
 
 		 853 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  27.65 
 
 		 853 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.96 
 
 		 852 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  27.65 
 
 		 853 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  30.14 
 
 		 866 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  30.14 
 
 		 861 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  30.14 
 
 		 866 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.14 
 
 		 865 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.24 
 
 		 880 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.68 
 
 		 886 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.16 
 
 		 866 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  27.48 
 
 		 872 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.24 
 
 		 850 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  24.84 
 
 		 939 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  28.37 
 
 		 839 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  26.07 
 
 		 865 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  26.32 
 
 		 914 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  26.32 
 
 		 914 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  28.65 
 
 		 866 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  28.21 
 
 		 883 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.21 
 
 		 883 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30 
 
 		 864 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  25.96 
 
 		 913 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  26.02 
 
 		 837 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 854 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 854 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.66 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  26.55 
 
 		 839 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  25.29 
 
 		 840 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  24.71 
 
 		 839 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  28.21 
 
 		 875 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.95 
 
 		 837 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  27.08 
 
 		 866 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.67 
 
 		 837 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  27.25 
 
 		 888 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.5 
 
 		 851 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.75 
 
 		 831 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.71 
 
 		 835 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.08 
 
 		 884 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.42 
 
 		 832 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.54 
 
 		 890 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.78 
 
 		 856 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.22 
 
 		 880 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.21 
 
 		 871 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.99 
 
 		 857 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  26.54 
 
 		 833 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2869  outer membrane usher protein  26.18 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.48 
 
 		 930 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  24.1 
 
 		 851 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.73 
 
 		 875 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.73 
 
 		 875 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.85 
 
 		 876 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  24.05 
 
 		 848 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  25.38 
 
 		 814 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  23.98 
 
 		 878 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  24.05 
 
 		 848 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.32 
 
 		 828 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  23.98 
 
 		 878 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  25.37 
 
 		 870 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  25.37 
 
 		 870 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  26.45 
 
 		 866 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  24.05 
 
 		 848 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.98 
 
 		 878 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  23.64 
 
 		 856 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  25.07 
 
 		 870 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>